Impliquée dès le début des négociations dans la réforme de la profession comptable, la FFCGEA participe activement à sa mise en place. Elle assure une assistance technique aux centres de gestion qui se transforment en associations de gestion et de comptabilité. Pour ce faire, elle a conçu des outils spécifiques (CD Rom, site Internet, etc.) mis à jour régulièrement afin de faciliter les démarches administratives de ses adhérents et la préparation des dossiers d’inscription à la Commission nationale au sein de laquelle elle siège. Elle assure le suivi et la défense de ces dossiers en relation constante avec les rapporteurs désignés.

Elle propose également à ceux des centres qui le souhaitent un accompagnement personnalisé en la matière par le biais d’audits internes sur la mise en place de la réforme et sur ses conséquences : encadrement, gestion du changement, etc.